Neosuite MNPD 微生物天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫
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最后更新：2014-03-04
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生產(chǎn)企業(yè)：創(chuàng)騰科技有限公司
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產(chǎn)品詳細(xì)介紹 (NeoSuite Microbial Natural Products Database, NeoSuite )
創(chuàng)騰科技有限公司和中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院生物技術(shù)研究所聯(lián)合開發(fā)的綜合性天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫。MNPD是基于Symyx 公司的ISIS Base化學(xué)信息管理系統(tǒng)構(gòu)建的，在數(shù)據(jù)庫設(shè)計和數(shù)據(jù)采集上借鑒了多個已發(fā)布的天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫的經(jīng)驗，數(shù)據(jù)內(nèi)容涵蓋了近幾十年來主要相關(guān)文獻(xiàn)，專利及專著中的微生物代謝物共15000多個，其中有確切化學(xué)結(jié)構(gòu)式的共10000多個。化合物的相關(guān)信息包括來源，制備，理化性質(zhì)，化學(xué)結(jié)構(gòu)，生物活性以及原始文獻(xiàn)等數(shù)據(jù)。MNPD可以為從事藥物化學(xué)，微生物學(xué)，生物化學(xué)，藥理學(xué)，新藥篩選，天然產(chǎn)物研發(fā)，組合化學(xué)，化學(xué)信息學(xué)等領(lǐng)域的科研人員提供極大的幫助，如天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)檢索，虛擬藥物篩選，構(gòu)效關(guān)系研究，作為組合化學(xué)的初始結(jié)構(gòu)等。
1、簡介
微生物天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(Microbial Natural Products Database，MNPD)是創(chuàng)騰科技有限公司和中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)藥生物技術(shù)研究所聯(lián)合開發(fā)的綜合性天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫。MNPD是基于MDL公司的ISIS Base化學(xué)信息管理系統(tǒng)構(gòu)建的，在數(shù)據(jù)庫設(shè)計和數(shù)據(jù)采集上借鑒了多個已發(fā)布的天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫的經(jīng)驗，數(shù)據(jù)內(nèi)容涵蓋了微生物天然產(chǎn)物的來源、制備、理化性質(zhì)、化學(xué)結(jié)構(gòu)、生物活性以及原始文獻(xiàn)等各方面信息，形成了數(shù)據(jù)全面、可滿足多種功能需求的綜合性的化學(xué)信息數(shù)據(jù)庫。
2、數(shù)據(jù)庫特性
首先，占全球80%市場份額的MDL ISIS化學(xué)信息管理系統(tǒng)擁有其獨特的優(yōu)勢，能夠方便的建立、管理和檢索化學(xué)信息數(shù)據(jù)庫，并且可以利用通用接口十分方便的與其他系統(tǒng)如Accelrys和Tripos公司提供的分子模擬及分子設(shè)計軟件配合使用。使用者無需計算機(jī)專業(yè)知識，只需進(jìn)行簡單培訓(xùn)即可對數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索、瀏覽和維護(hù)。另外，據(jù)不完全統(tǒng)計，迄今已從各種微生物發(fā)酵產(chǎn)物中分離得到20000多種代謝產(chǎn)物純品，其中具有生物活性的代謝產(chǎn)物達(dá)16000多種。而MNPD收集了近幾十年來主要相關(guān)專業(yè)文獻(xiàn)、專利及專著中的微生物代謝產(chǎn)物共15000多個，其中有確切化學(xué)結(jié)構(gòu)式的共10000多個。這些多樣性的結(jié)構(gòu)完全覆蓋了附表中所列出的所有微生物次級代謝產(chǎn)物的類別。
3、數(shù)據(jù)庫內(nèi)容
MNPD收集的信息包括以下各個方面的內(nèi)容：
• 基本信息：微生物天然產(chǎn)物的俗名、別名、IUPAC命名、分子式、分子量、化合類型、CAS登記號等
• 物化性質(zhì)和譜圖信息：微生物天然產(chǎn)物的顏色、晶型、熔點、旋光度、溶解性、紫外和紅外特征吸收峰等
• 結(jié)構(gòu)信息：已確定的微生物天然產(chǎn)物的二維分子結(jié)構(gòu)式及利用分子力學(xué)方法優(yōu)化得到的三維分子結(jié)構(gòu)
• 來源和生物活性：微生物產(chǎn)物的產(chǎn)生菌、制備方法及生物活性測試結(jié)果
• 原始參考文獻(xiàn)及專利信息 |
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